Det är svårt att försörja sig som marionettspelare. Det inser Craig Schwartz och söker istället jobb som arkivarie. En dag när Craig tappar ett dokument bakom ett skåp upptäcker han en lönndörr. En dörr som leder rakt in i skådespelaren John Malkovichs huvud.

Som ni hör är det här en rejält skruvad film. När Craig, som spelas av John Cusack, upptäcker lönndörren in till Malkovichs huvud öppnar sig en bisarr värld av förvecklingar. Till att börja med upptäcker han att man förstås kan tjäna pengar på att låta folk besöka Malkovichs huvud.
Sedan inser han att vistelsen i Malkovichs huvud är det enda som kan få drömkvinnan Maxine att bli hans.

Filmen är rolig, även om manuset till slut nästan slår knut på sig själv. Som när John Malkovich själv går in i lönndörren och in i sitt eget huvud…